L'Ospedale Policlinico San Martino è Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico per le discipline dell'Oncologia e delle Neuroscienze e si caratterizza come centro di ricerca sanitaria clinica e traslazionale e ospedale di alta specializzazione e di rilievo nazionale in coerenza con le disposizioni di legge vigenti e negli ambiti disciplinari individuati in conformità alla programmazione nazionale e regionale.
In particolare la missione è quella di perseguire, secondo standard di eccellenza, la ricerca (prevalentemente clinica e traslazionale)nel campo biomedico ed in quello dell'organizzazione e gestione dei servizi sanitari, di innovazione nei modelli di assistenza e di trasferimento delle conoscenze, unitamente a prestazioni di ricovero e cura di alta specialità.
La presenza della Scuola di Scienze mediche e Farmaceutiche dell'Università degli Studi di Genova, nel contesto della peculiarità dell'azienda ospedaliera universitaria integrata, ha implicazioni organizzative e operative ma anche "strategiche": infatti le esigenze didattiche comportano la necessità di garantire tutte le specializzazioni con docenti adeguati per numero e qualificazione, e di concentrare in Istituto, se possibile, le casistiche più ampie e diversificate.
Il Policlinico si caratterizza pertanto per la propria realtà polispecialistica e per la forte vocazione all'integrazione tra ricerca scientifica, assistenza e didattica tanto nelle strutture di diagnosi e cura quanto nei laboratori, in un contesto di coordinamento funzionale e strutturale.